中国科学院深海科学与工程研究所柏仕杰副研究员为第一作者，张培君研究员和李松海研究员作为通讯作者发表在期刊Water Biology and Security上题为“Similarities and differences in gastrointestinal microbiomes between wild and human-cared spotted dolphins (Stenella attenuata) in natural waters”的一项研究强调了生活在相似的环境中的热带斑海豚，食物来源差异是影响其肠道微生物群落组成的重要因素。

肠道微生物在食物消化中起着至关重要的作用，是宿主的第二免疫系统。尽管人们逐渐意识到它们的重要性，但由于采样困难，科研人员对海洋哺乳动物肠道微生物群落的了解仍然非常有限。

动物自身系统发育地位、生长环境和饮食等是影响肠道微生物组成的主要因素。然而，这三个因素间的从属地位目前尚不明确。本研团队先前的一项研究表明处于相似的饮食和水生环境中的海洋哺乳动物，科及以上分类地位的枝系间肠道微生物组存在显著差异。在此基础上，本次研究在环境因素上控制同一地理种群的热带斑海豚，着重调查了食物变化对其肠道微生物组的影响——野外海豚自然捕食，而人工饲养的海豚饲喂有限种类的食物鱼。

该研究使用 16S rRNA 基因的V4区对肠道微生物进行分类，发现野生和人工饲养的海豚在整体以及特定部位的胃肠道微生物群落在结构上存在着显著差异。有趣的是，它们胃肠道中的微生物多样性没有太大差异，这表明差异主要源于微生物群落组成的变化。

研究人员在野生海豚组（五个指示性ASVs）和人工饲养海豚组（三个指示性ASVs）中都发现了指示性微生物。此外，还发现了大量潜在的致病菌，这突显了未来对海洋哺乳动物肠道微生物学进行全面研究的必要性。

本文的研究结果不仅增强了科研人员对热带斑海豚肠道微生物学的理解，还清楚地阐述了同一海洋哺乳动物物种内胃肠道微生物群的相似性和差异，特别是当食物来源的变化在其生态生活中发挥重要作用时。

论文链接：https://doi.org/10.1016/j.watbs.2024.100288

野生（左）和人工饲养（右）的热带斑海豚后肠微生物群落组成在门（a）、科（b）和属（c）三个分类水平的对照