1947年10月10日，由北京大学生物系沈同、李汝祺、王平、崔芝兰、钱燕文等人发起成立了中国动物学会京津分会，1953年改为北京动物学会。1954年向北京市民政局申请备案，当时会员有70余人，挂靠在北京大学，目前已经历11届理事会。文革中档案遗失，前三届资料不详，1980年后北京动物学会恢复活动。现挂靠于北京麋鹿生态实验中心、北京自然博物馆，目前学会下设学术交流工作委员会、科普宣传工作委员会、青年人才工作委员会、教学培训工作委员会、科学考察与咨询委员会、组织工作委员会。

历届学会理事长、副理事长、秘书长名单

第一届（1947年—）

理事长：沈同

第二届

理事长：沈同

第三届

理事长：李汝祺

第四届（1984年—1989年）

理事长：王平

秘书长：许维枢

第五届（1989年—1994年）

理事长：钱燕文

秘书长：许维枢

第六届（1994年—1999年）

理事长：钱燕文

秘书长：冯祚建

第七届（1999年—2004年）

理事长：冯祚建

副理事长：杨思谅、张沅、左明雪

秘书长：李湘涛

第八届（2004年—2009年）

理事长：冯祚建

副理事长：饶成刚、许崇任、左明雪、张金国、杨奇森、苏建通

秘书长：段瑞华

第九届（2009年—2014年）

理事长：左明雪

副理事长：许崇任、张金国、杨奇森、孟安明、孟庆金、颜忠诚

秘书长：段瑞华

第十届（2014年—2018年）

理事长：许崇任

副理事长：孟安明、魏辅文、孟庆金、张正旺、张林源、张成林、朱立祥、吴雪梅

秘书长：段瑞华

第十一届（2018年—2023年）

理事长：张正旺

名誉理事长：许崇任

副理事长：白加德、杜卫国、张贵友、吴雪梅、丁长青、杨红珍、乔文军、段瑞华、张树苗

秘书长：张树苗

第十二届（2023年至今）

理事长：丁长青

名誉理事长：张正旺

副理事长：杜卫国、乔文军、王世雯、张雁云、任东、陶庆华、钟震宇

秘书长：张树苗